La Prefectura de Puerto Deseado, tuvo su origen el 5 de Junio de 1879 mediante Decreto se creó las Subdelegaciones de Río Gallegos y Puerto Deseado . La misión y objetivo del mismo era de crear estas subdelegaciones no solo con el fin de que pudieran auxiliar a los buques de todas las banderas, sino también con el propósito de hacer efectiva la ejecución de las Leyes y Reglamentos que se dictaran en lo relativo a la explotación de sus productos naturales. Este Decreto llevaba las firmas de Nicolás Avellaneda , Presidente de la Nación y el General Luis María Campos , Ministro de Guerra y Marina, cumpliéndose en forma parcial, ya que por razones de economía, solo se habilitó la Subdelegación de Río Gallegos, pero ya en este se designaba como Subdelegado en Puerto Deseado al Sargento Mayor de Marina Desierto Cuelli, quien no alcanzó a desempeñar el cargo por los motivos antes señalados. Posteriormente, con fecha 3 de abril de 1881, en la Presidencia de Julio Argentino Roca , se dictó un nuevo Decreto de fecha 11 de Octubre de 1880, mediante el cual y conforme el Art. 1° del mismo quedaba establecida la Subdelegación Marítima de Puerto Deseado. Por el Art. 2° se designaba el personal directivo de la nueva Subdelegación. Llegando los primeros integrantes ese mismo año, a cargo del Subdelegado, ex capitán de Infantería de línea.Nicanor Igarzábal , Ayudante de 1° José Navarro , Ayudante de 2° Pedro Martínez ,José Páez como cazador, y Eufrasia Arias , esposa de Páez , que fueron los primeros que poblaron este lugar con carácter definitivo, a partir del 3 de Abril del año 1881,   iniciando la construcción del edificio en la costa sur de la ría, frente a la baliza Alonso. Pocos años después, la Subdelegación se trasladó a la margen norte de la ría. Eufrasia Arias , fue la primer mujer que pobló Puerto Deseado, en razón de ello una calle de esta ciudad lleva su nombre. El estado le otorgó un lote pastoril, que fue conocido como “Estancia del Pajonal”, administrada luego por su hijo adoptivo Gabriel Ramírez. En el año 1896 la Subprefectura local, por razones económicas, fue replegada conjuntamente con las Subdelegaciones de Rawson y Bahia Thetis . En el año 1900 se reinstala nuevamente por el desarrollo que iba alcanzando el puerto, especialmente para embarcar lana ovina, ubicándose en una casilla precaria de madera y chapas, según consta en antecedentes manuscritos copilados por los propios jefes de aquel entonces, hasta que en Septiembre de l928 queda asentada en el actual edificio, jerarquizándose el 1º de febrero de 1988 a Prefectura. Los asentamiento de las unidades de la Prefectura Naval Argentina, constituyeron en la Patagonia Austral, una avanzada de soberanía Nacional, que a lo largo del tiempo, dieron origen a poblaciones que son hoy ciudades pujantes del sur argentino, de lo cual Puerto Deseado, en un claro ejemplo, toda vez que, el primer asentamiento poblacional, fue constituido por el contingente de Prefectura, que a cargo del Capitán Igarzábal , arribara a este paralelo el 3 de abril de 1881. A partir de su creación la Prefectura Puerto Deseado ha ido evolucionando permanentemente, siendo testigo y participe fiel del crecimiento y la historia misma de esta ciudad, logrando adaptarse con el correr del tiempo no solo a las exigencias propias de las funciones que cumple, sino que también a las que son requeridas desde la sociedad actual. Su esfuerzo, realizado en el resguardo de la Soberanía Nacional , el cumplimiento de las layes, el cuidado de la vida humana y de los recursos naturales, no podría haber sido realizado sin el valiente esfuerzo de nuestros predecesores, quienes supieron sobreponerse a toda adversidad, para que hoy nuestra Institución cumpla fiel y acabadamente con su misión. Por tal motivo, el Jefe de la Prefectura Puerto Deseado Prefecto Principal Juan Alberto Ivancich y el Jefe de la División Operaciones Prefecto, Arnaldo Matildo Ramírez , tienen el agrado de dirigirse al Personal en Actividad, Retirados y Familiares de esta Institución, a los efectos de hacerle llegar los más cálidos y sinceros saludos, con motivo de conmemorarse hoy 03 de Abril el 136º Aniversario del emplazamiento de la Prefectura Puerto Deseado en esta ciudad. Asimismo, queremos hacer llegar nuestro agradecimiento a la Municipalidad Puerto Deseado por el constante apoyo hacia la fuerza y a la comunidad en general por haber cobijado a los integrantes de esta Institución desde su arribo que fuera un 03 de Abril pero del año 1881. (Prensa Prefectura Puerto Deseado)